Contribution à l’étude par docking moléculaire de l’interaction entre l’alpha acide glycoprotéine et certaines molécules bioactives

Abstract

La distribution, la clearance et la stabilité de plusieurs molécules bioactives y compris des flavonoïdes, dépend largement de l’interaction de ces substances aux protéines plasmatiques, principalement l’albumine. L'alpha-1-acide glycoprotéine (AGP) est la deuxième protéine majoritaire du sang peut avoir les mêmes propriétés que l’albumine sérique humaine. Notre étude cible l’interaction entre certains flavonoïdes et la deuxième protéine majoritaire du sang l'alpha-1-acide glycoprotéine. La technique de docking moléculaire a été utilisée pour prédire la localisation, l’orientation et les types des liaisons établies entre ces molécules et cette protéine sérique via le logiciel SwissDock. Les résultats obtenus montrent que la ginestein, quercitin, chalcone, hesperetin, catechin, fisétine et luteolin se lient plus favorablement au site de fixation avec une énergie libre d’interaction -8.94 kcal/mol, -7.73 kcal/mol, -7.52 kcal/mol, -7.41 kcal/mol, -7.31 kcal/mol, -7.08 kcal/mol, -7.02 kcal/mol, respectivement. Alors que la ginestein présente la meilleure interaction, ces résultats aussi peuvent montrer le potentiel rôle de l’AGP comme transporteure des flavonoïdes. The distribution, clearance and stability of many bioactive molecules, including flavonoids, depends largely on the interaction of these substances with plasma proteins, mainly albumin. Alpha-1-acid glycoprotein (AGP) is the second major protein in blood and can have the same properties as human serum albumin. Our study targets the interaction between certain flavonoids and the second major blood protein alpha-1-acid glycoprotein. The molecular docking technique was used to predict the location, orientation and types of bonds established between these molecules and this serum protein via the SwissDock software. The results obtained show that ginestein, quercitin, chalcone, hesperetin, catechin, fisetin and luteolin bind more favorably to the binding site with a binding free energy of -8.94 kcal/mol, -7.73 kcal/mol, -7.52 kcal/mol, -7.41 kcal/mol, -7.31 kcal/mol, -7.08 kcal/mol, -7.02 kcal/mol respectively. While ginestein shows the best interaction, these results also may show the potentialrole of AGP as a flavonoid carrier.